Если двигатель меняется на другой, то для его оформления необходимо выполнить следующие этапы:
1. Обратиться в ГИБДД. Заполнить заявление на внесение изменений в конструкцию ТС. Данное заявление будет рассмотрено инспектором и будет дано указание получить разрешение в конкретной организации.
2. Обратиться в экспертную организацию (например, НАМИ). Здесь необходимо получить подтверждающий документ, о возможности замены двигателя и порядке его установки.
3. Заменить двигатель. Это можно сделать в техцентре, который имеет лицензию на проведение данных работ. По окончании нужно получить заявление-декларацию по выполненным работам, а также понадобятся копии лицензии и сертификаты данной организации. Допускается произвести замену самостоятельно, в этом случае заполнить заявление-декларацию нужно также самому.
4. Пройти ТО и проверку техсостояния и получить диагностическую карту.
5. Предоставить все полученные документы в ГИБДД и автомобиль к осмотру.
Если все действия будут выполнены правильно и всеми согласованны, то в результате инспектора ГИБДД выдадут Свидетельство о соответствии конструкции ТС, Свидетельство о регистрации ТС и паспорт ТС, с внесенными изменениями. Данная процедура может занять не одну неделю.
За неоформленный должным образом двигатель предусмотрен штраф от 500 до 800 рублей (ст. 12.1 КоАП РФ, за не зарегистрированный в установленном порядке автомобиль).
P.S. Я бы "забил" на замену двигателя.
P.P.S. Само собой, изменится транспортный налог (не в меньшую сторону).